Le Jedi Even Piell a été capturé par les Séparatistes ! Une mission de rescousse est montée pour l’extraire de La Citadelle où il est retenu prisonnier.
Récupéré Piell est en effet vital pour le sort de la galaxie, il est en possession d’informations hautement sensibles sur une route hyperspatiale connectant les territoires séparatistes et républicains. Si l’ennemi parvient à faire craquer le Jedi avant que ses camarades ne puissent pénétrer dans cette inexpugnable prison, la République serait en péril.
Le plan d’Anakin pour s’infiltrer dans la Citadelle sans être repéré est de se faire congeler dans de la carbonite et de laisser R2-D2 et des Droïdes de combat B1 trafiqués conduire la Navette Sheathipede. La mission étant extrêmement dangereuse, Anakin refuse qu’Ahsoka les accompagne dans cette prison qui a été créée exprès pour maintenir captif les Jedi et les torturer. La Padawan ne comprend pas cette décision injuste et confie à Plo Koon ne pas pouvoir apprendre et progresser correctement à cause de son maître qui a tendance à la surprotéger.
Malgré le protocole de sécurité renforcé de la Citadelle, la navette parvient à se poser sur la planète Lola Sayu sans que le droïde tactique K2-B4 ne repère les Jedi et les clones à bord. Lorsque ces derniers sont finalement décongeler pour mener à bien leur mission, Anakin s’aperçoit avec grande surprise que sa Padawan fait parti de l’équipe. Ahsoka lui explique alors que Plo Koon l’a assignée à la mission à la dernière minute sans avoir eut le temps de les informer. Anakin pense plutôt qu’elle a désobéi aux ordres mais Obi-Wan l’accueille dans leur groupe avec grand plaisir.
L’équipe commence donc l’ascension de la falaise les menant à la Citadelle avec Ahsoka. Une fois arrivée au point d’accès prévu pour entrer dans la prison, Obi-Wan se rend compte que celui-ci est bloqué et qu’il impossible de le franchir. La Padawan se propose alors pour passer par l’étroit système de ventilation afin de déverrouiller l’accès de l’intérieur et de permettre aux adultes de pénétrer discrètement dans la forteresse. Mais malheureusement, le clone Charger chute du haut de la falaise et active une électro-mine.
Comprenant qu’une équipe de Jedi tente de pénétrer La Citadelle pour libérer Even Piell, le directeur de la prison Osi Sobeck déclenche immédiatement l’alerte maximum et verrouille toutes les issues. La progression dans la Citadelle est alors laborieuse et compliquée pour les Jedi, le clone Longshot est ainsi le suivant à être tué, mais ils parviennent finalement jusqu’à la cellule de Piell. Ce dernier leur explique alors qu’il faut également secourir son capitaine avec qui il a partagé les informations sur la route hyperspatiale.
L’équipe doit donc affronter des nouveaux pièges dont des Droïdes commando BX spécialement conçus pour affronter des Jedi. Ils arrivent malgré tout à la cellule où se trouvent les officiers clones et le capitaine Wilhuff Tarkin. Malgré les objections de ce dernier, il est décidé de diviser en deux l’équipe pour avoir plus de chance de quitter la forteresse, Kenobi et Piell montent dans les étages supérieurs pour trouver une sortie par le haut pendant qu’Anakin et Tarkin redescendent plus bas pour rejoindre R2-D2.
Les deux groupes progressent difficilement dans cette prison connue pour n’avoir jamais laissé un prisonnier s’enfuir. Tarkin en est bien conscient et reste très sceptique sur la réussite de la mission, surtout qu’il ne se gêne pas pour afficher une défiance envers les Jedi et leur capacité à mener à bien une mission. Une attitude qu’Anakin trouve détestable.