Pendant des milliers d’années,
Ruusan demeura un monde paisible et retiré, en marge de l’évolution technologique que suivaient les mondes placés sous la protection de la
République Galactique. Mais en 1 002 av B.Y., la planète devint soudainement le théâtre d’une guerre sanglante. À l’époque, les Sith sévissaient sous le drapeau de la
Confrérie des Ténèbres, et les Jedi et les soldats de la république qui avaient eut le courage de se dresser contre l’ennemi s’étaient rassemblés sous le drapeau de l’Armée de la Lumière. Ruusan fut donc ravagée par les batailles successives qui réduisaient les rangs des deux camps. Les premières batailles virent les Sith victorieux et la République ne parvint pas à reprendre ses positions. Mais lors de la Troisième Bataille de Ruusan, l’Armée de la Lumière, une armée de milliers de Jedi, se dressa pour reconquérir la planète. En tout, huit batailles se succédèrent. La huitième se conclut par la destruction de la Confrérie des Ténèbres et de l’Armée de la Lumière. Les quelques cités qui avaient fleuries à la surface de la planète avaient été rasées, des forêts entières brûlées, des lacs empoisonnés. La guerre prit fin mais tout l’écosystème de Ruusan était détruit. Quelques temps après la fin de la guerre, le
Sénat Galactique vota la construction d’un gigantesque mausolée dédié aux Jedi disparus pendant la guerre. La
Vallée des Jedi fut construite mais avec le temps, l’identité des artisans qui l’avaient bâtie fut perdue. Pire encore, la République Galactique oublia elle-même l’existence de Ruusan.
Retombée dans l’oubli, la faible population de Ruusan muta pour devenir les Ruusaniens. Tout accès à la planète devint quasiment impossible lorsqu’une nébuleuse instable oblitéra les routes hyperspatiales y conduisant. La planète revint à son état initial et resta ainsi plus de mille ans. Jusqu’à ce qu’elle soit redécouverte par un contrebandier du nom de Jerg, en 11 av B.Y. À ce moment, la galaxie était sous le joug de l’Empire Galactique et le seul espoir de la galaxie était la Rébellion. Afin de remédier à la situation isolée de la planète, des réfugiés y furent transportés afin de bâtir une colonie : le Fort Perdu. Mais cette installation de réfugiés marqua à nouveau l’arrivée d’un danger.
Jerec, un Jedi Noir puissant et ambitieux, avait apprit l’existence de la Vallée des Jedi et avait décidé de s’emparer du pouvoir qu’elle renfermait. À l’issue d’une enquête, le Jedi Noir parvint à mettre la main sur une carte menant tout droit à la Vallée et il se dépêcha d’y installer un avant-poste. Cependant, un homme se dressa sur sa route :
Kyle Katarn. Fils de fermier, Kyle Katarn devint un Chevalier Jedi et sous la tutelle de
Qu Rahn, il se lança à la poursuite de Jerec. Lorsque Katarn atteignit le cœur de la Vallée des Jedi, Jerec s’était déjà emparé du pouvoir contenu dans le mausolée. Mais cela n’arrêta pas le Jedi et grâce à la Force, il parvint à éliminer Jerec et à libérer les esprits des Jedi et des Sith piégés dans la Vallée depuis la Huitième Bataille de Ruusan qui avait eut lieu mille ans plus tôt. Hors de danger, Katarn referma la Vallée des Jedi pour que personne ne puisse la retrouver. Ruusan redevint une planète isolée et calme.