Par la suite, il continua la politique aux côtés de la reine
Jamillia, qui succéda à Amidala. Cette dernière représentait
Naboo en tant que sénatrice au
Sénat Galactique sur
Coruscant. Il aida Amidala avant le début de la Guerre des Clones, lorsque
Jango Fett avait tenté de tuer la sénatrice sur Coruscant. Il fut toujours actif lors de la Guerre des Clones. Il continua à servir la reine
Neeyutnee, qui succéda à Jamillia, et fut présent lorsqu'un laboratoire secret avait été construit par le savant fou
Nuvo Vindi dans les sous-sols de Naboo.
Obi-Wan Kenobi,
Anakin Skywalker et la padawan
Ahsoka Tano sauvèrent Naboo d'une extermination totale.
Il participa également au Festival des Lumière, événement annuel se tenant à
Theed sur Naboo qui fête l'entrée de Naboo dans la République. Cependant, durant la Guerre des Clones, Naboo resta une cible privilégiée des Séparatistes dès que l'occasion se présentait. Le festival fut marqué par une tentative d'enlèvement du Chancelier Suprême
Palpatine par une équipe de chasseurs de primes. Ces derniers avaient été spécialement choisis par le Comte
Dooku, et étaient sans doute les meilleurs de la galaxie.
Sio Bibble fut escorté avec le reste des officiels en lieu sûr par la padawan
Ahsoka Tano. Encore une fois, Anakin Skywalker et Obi-Wan
Kenobi sauvèrent la situation et arrêtèrent notamment
Cad Bane et
Moralo Eval.
Quand la Guerre des Clones s'acheva, en l'an 19, Sio fut présent lors des funérailles de Padme Amidala, qui se tenaient à Theed.