Au début de la Guerre des Clones, Jek était assigné à des missions diplomatiques ou d’escortes. A cause du calme de ses missions, Jek était devenu obsédé par les armes. Il était devenu un expert dans tous les types de blasters légers, et avaiy réussi à obtenir des armes lourdes comme un Canon blaster rotatif Z-6 ou un lance-missiles PLEX.

Jek avait finalement eu la chance de tester ses armes favorites quand lui et Rys, sous le commandement du Lieutenant Thire furent affectés à l’escorte du Maître Jedi Yoda pendant une mission diplomatique sur Rugosa pour renconter le Roi Katuunko. Quand leur transport se fit attaquer par des frégates Munificent, Yoda et les trois clones atterrirent sur la lune dans une capsule de sauvetage. Les clones aidèrent Yoda à franchir un bataillon entier de Droïdes de Combat B1 accompagnés de CAB. Ceux-ci avaient été envoyés par Asajj Ventress pour les intercepter, comme un défi pour évaluer le Jedi et les forces de la République pour assurer un traité avec le Roi Toydarien Katuunko. Pendant la mission, Yoda avait averti Jek que son arme la plus puissante n’était pas le matériel qu’il portait, mais que c’était son esprit. Cette leçon marcha avec Jek, qui avec ses camarades clones fut capable d’improviser le sauvetage de Yoda alors qu’il était attaqué par des Droïdes Destroyer beaucoup plus nombreux que lui, ce qui leur permit de réussir leur mission, d’empêcher Ventress de tuer Katuunko et d‘établir une base républicaine sur Toydaria.