Rune
Haako fut bien connu pour avoir été le conseiller avisé du vice-roi de la
Fédération du Commerce. Etant un politicien redoutable, il excella également dans les négociations commerciales où il fut impitoyable et manipulateur. Quand Sidious prit contact avec
Nute Gunray et le convainquit de créer une armée droide, Haako fut alors chargé de l’implantation des droides pour protéger les mondes sur lesquels la Fédération en avait le contrôle.
Quand le Seigneur Noir des Sith influença les Neimoidiens jusqu'à l’accord du blocus de
Naboo, le Chancelier envoya discrètement deux chevaliers Jedi gardiens de la paix et de la justice pour enquêter sur cette affaire.
Rune Haako prit soudainement peur à la vision des Jedi alors que
Dark Sidious ordonna leur exécution. Tant bien que mal, le maître
Qui-Gon Jinn et son padawan
Obi-Wan Kenobi réussissent à échapper aux griffes de la Fédération. Haako n’aimait pas les Jedi et sa nature craintive le poussa à se méfier du Seigneur Noir des Sith. D’ailleurs il ne manqua pas de faire partager son opinion à plusieurs reprises à Gunray, notamment quand il prit connaissance de l’existence de l’apprenti Sith
Dark Maul, alors qu’il aidait Gunray à mener ses plans de conquête contre les Naboo et les Gungans. Malheureusement pour lui, la reine Amidala revint sur la planète et avec l’aide de ses gardes du corps Jedi et à la tête d’une puissante armée
Gungan et Naboo, elle réussit à pénétrer dans l’enceinte du palais, et capturer Gunray ainsi que Rune Haako mettant alors fin à cette crise ayant commencé par la taxation des routes commerciales.
Comme le vice-roi, Haako passa devant la cour suprême galactique et comme Gunray, il ne put être démis des ses fonctions. Il continua dès lors à suivre le vice-roi durant ses nouveaux projets. La Fédération signa le traité de la Confédération des Systèmes Indépendants et la Guerre des Clones éclata peu après, déchirant la galaxie en deux.