Les Syndulla ont été arrêtés ! L’Empire accuse les héros de la libération de Ryloth d’avoir assassiné le Sénateur Orn Free Taa.

Ainsi, l’Amiral Rampart ordonne au clone Howzer de retrouver tous les sympathisants de Cham Syndulla pour les arrêter sous l’accusation de rébellion et demande à Crosshair de retrouver au plus vite Hera Syndulla. Cette dernière a de son côté réussi à contacter la Bad Batch grâce à Chopper pour leur demander de venir en aide à sa famille. Hunter et Tech sont pourtant sceptiques sur la nécessité de retourner sur Ryloth pour cette affaire qui ne les concerne pas mais Omega parvient à les convaincre que de bons soldats sont toujours prêts à risquer leurs vies pour sauver des innocents.

Une fois de retour sur la planète des Twi'leks Hera peut alors leur expliquer la situation et leur supplie une nouvelle fois de l’aider. Les membres de la Bad Batch sont ensuite témoin du discours de l’Amiral Rampart devant la population de Lessu cherchant à convaincre les locaux de la trahison de Cham Syndulla. Les clones constatent ainsi que la présence impériale sur Ryloth est tout aussi importante que sur Raxus alors que cette planète ne s'est pourtant jamais affiliée au mouvement séparatiste.

Malheureusement, un Droïde Vipère repère la Bad Batch et leur présence aux abords du Capitole est immédiatement transmise à leur ancien camarade Crosshair. L’opération pour libérer les parents d’Hera devient alors trop dangereuse car ils ont perdu l’effet de surprise et Hunter est décidé à quitter la planète au plus vite avant qu’ils ne soient capturés.

Du côté impérial, Rampart demande à Howzer de poursuivre les arrestations de citoyens hostiles à leur présence sur Ryloth. Mais le clone essaie plutôt, malgré la confiance brisée avec ses anciens alliés Cham et Eleni Syndulla, de retrouver Hera pour la protéger de l'Empire. Heureusement, Crosshair a, lui, abandonné ses recherches pour localiser la jeune fille et préfère se focaliser sur la défense du Capitole contre la Bad Batch.

En effet, Hera et Omega ont finalement convaincu Hunter d'aider la résistance twi'lek en lui présenant un plan pour libérer les prisonniers de l’Empire. Ainsi, les deux jeunes filles accompagnent Chopper pour qu’il désactive les canons protégeant la raffinerie impériale de Doonium afin que Wrecker et Tech y fassent diversion en attaquant le complexe industriel. Hera prend ensuite les commandes d’une Navette de classe Rho pour attaquer le système de défense de l’installation impériale et le Havoc Marauder est ainsi libre de la détruire pour y attirer les forces ennemies.

Hunter et Echo peuvent donc s’infiltrer discrètement dans le Capitole mais Crosshair ne tombe pas dans le piège et reste auprès des prisonniers pour y attendre ses anciens compagnons. Ces derniers sont cependant prévenus par Howzer qu'ils sont attendus mais ils parviennent tout de même à libérer les héros de Ryloth en évitant leur ancien camarade. La Bad Batch peut alors quitter la planète avec la famille Syndulla au complet et retourner sur Ord Mantell.

À Lessu, Howzer se présente devant ses hommes pour leur demander de ne plus obéir aux ordres des officiers impériaux, ils sont venus sur Ryloth pour libérer ses habitants de la présence séparatistes pendant la Guerre des Clones et non pas pour devenir les bourreaux de cette même population alors que la paix est revenue. Crosshair demande alors à son commando de l’arrêter et de faire de même pour tous les clones qui s’apprêtaient à se ranger derrière lui car les bons soldats obéissent aux ordres. L’Amiral Rampart donne ensuite la permission à Crosshair de traquer la Bad Batch car leur présence sur Ryloth a démontré qu’ils pouvaient déstabiliser l’occupation impériale sur une planète.

Sur Ord Mantell, Hunter refuse de prendre les crédits que les Syndulla lui proposent pour les avoir libérés. Il préfère les avertir que d’autres planètes subissent le même sort que Ryloth et qu’ils doivent désormais se préparer à la prochaine guerre contre l’Empire. Avant de se quitter, Omega et Hera se promettent de se revoir.