La Guerre des Clones fut l'occasion pour la jeune
Obs Kaj de remettre en question sa vie de Jedi. Souhaitant même n'avoir jamais quitté sa planète natale, elle envisagea de quitter l'Ordre après sa mission sur Katanos VII, où elle fut envoyée, quinze mois après le début de la Guerre des Clones, avec
Lunis, son Maître. Mais leur tâche se compliqua, lorsque Obs découvrit qu'un complexe de clonage illégal était bel et bien installé dans la colonie minière, et les deux Jedi furent alors attaqués par des Gundarks en armure de cortosis. Quand Lunis perdit la vie, Kaj ne put s'empêcher de se blâmer pour ne pas lui avoir porté assistance, malgré leurs relations détériorées, mais réussit tout de même à rejoindre son chasseur stellaire, et à s'échapper. Une fois dans l'espace, elle fut cependant interceptée par le vaisseau du Comte
Dooku, qui l'envoya rejoindre son Maître dans la Force.