La Flotte Noire était le nom d'une puissante force d'intervention secrète de l'Empire Galactique repliée dans l'Amas de Koornacht, sous les ordres de Jian Paret, suite à la défaite d'Endor. Mais rapidement, les indigènes Yevethas se révoltèrent contre les oppresseurs impériaux pour s'emparer de la Flotte et son principal chantier naval, Black 15. Dès lors, la Flotte constitua le coeur de la force armée de la Ligue Duskhan, qui asservit les survivants impériaux, et se vit ajouter de très nombreux vaisseaux construits par les Yevethas eux-mêmes.
Au cours de l'épuration de l'Amas et la guerre avec la Nouvelle République, la Flotte Noire comportait plus d'une soixantaine de navires mais un grand nombre fut détruit par les combats, jusqu'à la bataille de N'zoth où l'impérial Sil Sorannan organisa une révolte et récupéra les destroyers d'origine des mains des Yevethas pour se retirer sur Byss. Mais ce coup d'éclat fut mis à mal lorsqu'une grande partie des équipages se rendirent d'eux-même à la Nouvelle République, tandis que certains ralliaient les forces de Daala ou de Pellaeon. D'autres navires furent simplement perdus ou laissés à l'abandon.Le nombre originel de vaisseaux appartenant à cette force d'intervention reste inconnu, bien que les données récupérées par la Nouvelle République dans l'épave du Gnisnal prouvent l'existence d'au moins 44 navires capitaux, dont trois Super Destroyers Stellaires.
Les plus importants vaisseaux de cette flotte se sont illustrés au cours de la guerre contre la Nouvelle République :
A cela s'ajoutaient de nombreux chasseurs et la possession de plusieurs chantiers navals.