Hunter était le leader de l'escouade Bad Batch, une unité d'élite composée de clones nés avec des mutations génétiques durant la guerre des clones. La particularité de Hunter - et ce pourquoi il était le leader du groupe - était ses sens décuplés lui permettant, par exemple, de sentir les fréquences électromagnétiques.

En l'an -20, L'escouade fut appelée sur Anaxes pour aider l’armée régulière face aux Séparatistes. La mission qui leur fut confiée était l’infiltration du Centre Cybernétique d’Annaxes pour récupérer un algorithme séparatiste en compagnie de Cody, Rex, Kix et Jesse. Hunter dût en premier calmer les frictions entre ses hommes et ces clones lambda mais au final la collaboration entre tous les soldats permit à la mission d’être un succès.

Il fut cependant découvert durant la mission que les séparatistes n’utilisaient pas un algorithme mais le clone Echo pour déjouer l’armée républicaine. Une mission fut alors mise sur pied par Anakin Skywalker et Rex pour vérifier si Echo était réellement prisonnier sur Skako Minor où, comme le pensait Hunter, s’il s’agissait d’un piège séparatiste. Dès leur arrivée sur la planète, le général Skywalker fut fait prisonnier par le Chef Poletec et Hunter partit seul à sa rescousse avant que toute l’escouade libère Anakin sans blesser un seul Poletec pour ne pas provoquer les autochtones.

Ces derniers acceptèrent finalement de les accompagner jusqu’à Purkoll, la ville contrôlée par le Techno Syndicat. Une fois infiltrés à l’intérieur du complexe ennemi, Hunter et ses camarades parvinrent à rejoindre Echo qu’ils retrouvèrent inconscient et branché au système informatique du Syndicat. Malheureusement, Wat Tambor avait tout prévu grâce au cerveau de son prisonnier et ils se retrouvèrent pris au piège, cernés par une armée de droïdes.

L’escouade parvint tout de même à échapper de peu aux effets dévastateurs d'un décimateur et put s’enfuir du complexe du Techno Syndicat grâce à Echo qui, débranché, possédait toujours les plans de l'organisation ennemie dans son cerveau. Ils regagnèrent alors le village poletec et défendirent les autochtones contre l’armée de Wat Tambor, bien conscients de leur avoir apporté la guerre jusqu’à chez eux, avant d’enfin repartir vers Anaxes.

Sur Anaxes, Mace Windu décida finalement de lancer l’offensive finale et envoya la Bad Batch avec Anakin Skywalker et Rex infiltrer le vaisseau de l’amiral Trench pour que Echo puisse se brancher au système séparatiste et prendre le contrôle de l’armée droïde. Hunter, comme tous les autres membres de la Bad Batch, n’avait toujours pas confiance en Echo et n’était pas rassuré à l’idée que tout le plan repose sur les épaules d’un possible traître. Mais si d’abord le clone donna des ordres très osés aux droïdes, sa tactique se révéla finalement victorieuse et la République put reprendre le contrôle totale d’Anaxes grâce aux capacités exceptionnelles de Echo.

Ce dernier démontra ainsi qu’il avait toutes les caractéristiques pour intégrer la Bad Batch et Hunter accueillit avec joie Echo comme un nouveau membre de l’escouade.

Dans les semaines qui suivirent, l’escouade Bad Batch fut dépêchée sur la planète Kaller où la générale Jedi Depa Billaba était aux prises avec les forces séparatistes. Fidèles à eux-mêmes, redoutablement efficaces, Hunter et ses camarades furent d’un grand secours et en quelques instants, ils renversèrent le cours de la bataille : malgré leur infériorité numérique, les clones de la Bad Batch parvinrent à surpasser les droïdes de combat, les obligeant à se replier.

Afin de profiter de l’avantage temporaire qu’ils venaient de gagner, Hunter décida de mener la contre-attaque. Hélas, il n’en eut pas le temps : c’est à cet instant que l’Ordre 66 fut ordonné par Sheev Palpatine (aka Dark Sidious). En un instant, Depa Billaba tomba sous le feu de ses propres troupes tandis que son Padawan, le jeune Caleb Dume, prit la fuite. Ne comprenant pas ce qui venait de se produire ni ce que signifiait l’Ordre 66, Hunter se lança à la poursuite de l’apprenti Jedi, accompagné par Crosshair. Toutefois, ce dernier ne semblait plus être le même et tenta, dès qu’il en eut l’occasion, d’abattre le Padawan. Hunter l’en empêcha : tant qu’il ne savait pas pourquoi il leur était demandé de tuer leurs anciens généraux, il ne pouvait se résoudre à obtempérer. Caleb profita de ce bref instant de répit pour s’enfoncer dans la forêt et disparaitre.

La guerre des clones venait de s’achever. Selon ce qu’il se racontait, les Jedi avaient tenté un coup d’état et donc, par conséquent, été déclarés comme traîtres. Tout aussi étonnant, la République serait prochainement réorganisée en un nouvel Empire Galactique. Hunter affirma alors à ses supérieurs que l’apprenti Jedi avait été tué, s’attirant au passage les foudres de Crosshair, parfaitement au courant du mensonge de son chef d’escouade.

La Bad Batch retourna sur Kamino, leur monde natal, espérant y voir plus clair et faire le point sur les derniers événements. Ils se rendirent vite compte que leur foyer, tout comme leurs frères, les clones « réguliers » (non modifiés génétiquement) n’étaient plus tout à fait les même. Quelque chose n’allait pas. C’est alors qu’ils firent la rencontre d’Omega, la jeune assistante de laboratoire de Nala Se. Cette dernière était particulièrement au fait des agissements de la Bad Batch et, à leur grande surprise, semblait les connaître. Selon elle, Kamino était devenu un endroit dangereux pour les clones uniques qu’ils étaient !

D’ailleurs, Hunter et ses compagnons ne tardèrent pas à s’en rendre compte. L’Amiral Wilhuff Tarkin débarqua à Tipoca City avec pour tâche d’évaluer les compétences des soldats clones, dans l’optique de réorganiser l’armée du nouvel Empire. Alors que la Bad Batch passait une simulation de combat, Tarkin n’hésita pas à activer le mode mortel des droïdes d’entrainement afin de les pousser dans leurs derniers retranchements. Hunter, Tech, Crosshair, Wrecker et Echo se retrouvèrent à lutter pour leur survie. Finalement, Tech parvint à modifier la programmation de l’un des droïdes et ainsi s’en servir pour venir à bout des autres.

Si Tarkin fut impressionné, il n’en montra rien et confia à la Bad Batch sa toute première mission pour l’Empire Galactique : éradiquer un groupe de rebelles menés par Saw Gerrera sur Onderon. Mais alors que les clones s’attendaient à affronter les vestiges de l’organisation séparatiste, il se retrouvèrent face à un groupe de femmes, d’enfants et de réfugiés dont le seul crime avait été de s’opposer au nouveau régime. Gerrera expliqua à Hunter que ce n’était qu’une question de temps avant que l’Empire ne piétine tout ce pour quoi il s’était battu durant la guerre des clones. Il laissa alors le choix aux soldats de choisir leur camp : rester fidèle à un régime totalitaire ou le rejoindre dans sa lutte. Hunter, préféra alors désobéir aux ordres de Tarkin et laissa à Saw Gerrera le temps d’évacuer les siens vers un refuge plus sûr. Pour Crosshair, ce fut l'acte d'insubordination de trop après qu'Hunter eut épargné le Padawan Caleb Dume. Selon lui, un bon soldat se devait de suivre les ordres.

De retour sur Kamino, les cinq membres de la Bad Batch furent mis aux arrêts pour trahison. La mission sur Onderon avait été un test pour vérifier leur loyauté, test que seul Crosshair avait réussi en s’opposant à son chef. Crosshair fut donc séparé du reste de son groupe et Tarkin, comprenant que le soldat pouvait encore servir les intérêts du nouveau régime, demanda aux Kaminoans d’amplifier les effets de sa Puce Inhibitrice, ce dispositif implanté en chaque clone pour « réguler leur agressivité ».

Bien évidemment, Hunter s’était attendu à devoir subir les conséquences de son acte. Si la Bad Batch était retournée sur Kamino, c’était pour retrouver et emmener avec eux Omega. En effet, Tech avait affirmé que la jeune fille était exactement comme eux : un clone modifié de Jango Fett. Par conséquent, ils ne pouvaient pas laisser une de leur semblable aux mains de l’Empire. D’ailleurs, ce fut en cellule qu’ils retrouvèrent la fillette, surprise quelques temps plus tôt à fouiner dans les baraquements de la Bad Batch.

Par sa petite taille, Omega se révéla être une alliée précieuse : la jeune fille parvint à se faufiler hors de leur cellule par les conduits et ainsi en ouvrir l’accès depuis l’extérieur. Ni une, ni deux, l'escouade se dirigea vers le hangar où se trouvait leur vaisseau, le Havoc Marauder. Là, ils eurent la désagréable surprise de se retrouver face à… Crosshair ! La « programmation » de ce dernier ayant été réinitialisée par l’Empire et les Kaminoans, il n’eut aucun scrupule à s’opposer à ses anciens camarades et porta même un sérieux coup à Wrecker.

Après un bref affrontement contre leur ancien frère d'arme d'armes, Hunter, Wrecker, Tech, Echo, suivis par Omega quittèrent Kamino, laissant derrière eux le seul endroit qui avait été un foyer. La guerre était finie et dorénavant, ce nouvel Empire ne leur laisserait plus un moment de répit. La Bad Batch n’aurait de cesse d’être traquée. Conscient de ce fait, Hunter décida qu’il était temps d’entamer une nouvelle vie loin des conflits et d'apprendre à faire profil bas.