Lyonie était un Gungan Otolla qui obtint le poste de Boss durant la Guerre des Clones. Pendant la Seconde Bataille de Mon Calamari, le peuple du même nom et le Conseil Jedi demandèrent de l'aide au Boss Lyonie afin qu'il autorise l'envoi de troupes aider les Mon Cals contre les Quarrens et les Séparatistes. Bien qu'il fasse preuve de réticence au début, il fut rapidement convaincu par le représentant Jar Jar Binks qui mit en avant le fait que la Sénatrice Amidala, amie des Gungans, était également prisonnière sur place. Lyonie envoya donc son armée, Jar Jar en tête pour aider les Calamariens.

Peu de temps après ces évènements, le Boss Lyonie reprocha de nombreuses choses aux Naboos comme l'épuisement des ressources de la planète. Il ordonna alors que l'armée Gungan marche sur Theed, capitale Naboo. Jar Jar Binks et le Général Roos Tarpals s'étonnèrent de ce comportement et firent appel à la Sénatrice Amidala qui arriva avec son garde du corps, le Jedi Skywalker. Ensemble, ils découvrirent rapidement que Lyonie était sous l'effet d'un collier mystique. En réalité c'était le conseiller Rish Loo qui était derrière cette histoire. Une fois dégagé de l'influence du collier, Lyonie alla voir Rish pour lui demander de rendre des comptes mais la discussion évolua en pugilat et Rish blessa gravement Lyonie qui frôla la mort. Il fut placé en sécurité à l'infirmerie pendant que le reste des intervenants tentait de résoudre la situation. 

Jar Jar Binks se fit passer pour Lyonie et alla occuper Grievous qui venait de débarquer pour prendre la tête des forces Gungans et marcher sur les Naboos. Les Gungans finirent par capturer Grievous mais Tarpals y laissa la vie. Malheureusement dans le même temps, Skywalker se fit également capturer. Padmé négocia un échange et les Séparatistes quittèrent la planète suite à un statu quo. Lyonie ne manqua pas de remercier et féliciter Jar Jar Binks pour son implication dans cette aventure.