Rune Haako fut bien connu pour avoir été le conseiller avisé du vice-roi de la Fédération du Commerce. Etant un politicien redoutable, il excella également dans les négociations commerciales où il fut impitoyable et manipulateur. Quand Sidious prit contact avec Nute Gunray et le convainquit de créer une armée droide, Haako fut alors chargé de l’implantation des droides pour protéger les mondes sur lesquels la Fédération en avait le contrôle.
Quand le Seigneur Noir des Sith influença les Neimoidiens jusqu'à l’accord du blocus de Naboo, le Chancelier envoya discrètement deux chevaliers Jedi gardiens de la paix et de la justice pour enquêter sur cette affaire. Rune Haako prit soudainement peur à la vision des Jedi alors que Dark Sidious ordonna leur exécution. Tant bien que mal, le maître Qui-Gon Jinn et son padawan Obi-Wan Kenobi réussissent à échapper aux griffes de la Fédération. Haako n’aimait pas les Jedi et sa nature craintive le poussa à se méfier du Seigneur Noir des Sith. D’ailleurs il ne manqua pas de faire partager son opinion à plusieurs reprises à Gunray, notamment quand il prit connaissance de l’existence de l’apprenti Sith Dark Maul, alors qu’il aidait Gunray à mener ses plans de conquête contre les Naboo et les Gungans. Malheureusement pour lui, la reine Amidala revint sur la planète et avec l’aide de ses gardes du corps Jedi et à la tête d’une puissante armée Gungan et Naboo, elle réussit à pénétrer dans l’enceinte du palais, et capturer Gunray ainsi que Rune Haako mettant alors fin à cette crise ayant commencé par la taxation des routes commerciales. Comme le vice-roi, Haako passa devant la cour suprême galactique et comme Gunray, il ne put être démis des ses fonctions. Il continua dès lors à suivre le vice-roi durant ses nouveaux projets. La Fédération signa le traité de la Confédération des Systèmes Indépendants et la Guerre des Clones éclata peu après, déchirant la galaxie en deux. 

Constamment, les leaders séparatistes dont Haako durent fuir pour ne pas être pris comme prisonniers par les Jedi. Puis, à la mort du Comte Dooku, Haako ainsi que les autres leaders furent placés en sécurité sur la planète volcanique de Mustafar. Là, le Seigneur des Sith Dark Sidious trahit la Confédération pour prendre le contrôle absolu de la République. Il envoya son nouvel apprenti, le seigneur Vador pour éliminer tous les leaders afin de terminer cette Guerre des Clones. D’un coup de sabre, Rune Haako fut assassiné par le sombre Seigneur des Sith.

Lorsque Dark Sidious s’identifia auprès des responsables de la Fédération du Commerce en tant que Seigneur Sith, le seul membre de l’organisation qui resta dubitatif était Rune Haako. Il avança le manque de preuves de la puissance de Sidious ainsi que de la prétendue manipulation de ces utilisateurs de la Force. Durant la signature du traité d’Eriadu, la plupart des membres de la Fédération du Commerce furent assassinés par le Front Nébula et sur ordre de Dark Sidious. L’organigramme de la Fédération du Commerce changea littéralement, ce qui offrit à Haako le rôle de superviseur de la future armée de droïdes destinée à envahir Naboo.

Rune Haako fut bien connu pour avoir été le conseiller avisé du vice-roi de la Fédération du Commerce. Etant un politicien redoutable, il excella également dans les négociations commerciales où il fut impitoyable et manipulateur. Quand Sidious prit contact avec Nute Gunray et le convainquit de créer une armée droide, Haako fut alors chargé de l’implantation des droides pour protéger les mondes sur lesquels la Fédération en avait le contrôle.
Quand le Seigneur Noir des Sith influença les Neimoidiens jusqu'à l’accord du blocus de Naboo, le Chancelier envoya discrètement deux chevaliers Jedi gardiens de la paix et de la justice pour enquêter sur cette affaire. Rune Haako prit soudainement peur à la vision des Jedi alors que Dark Sidious ordonna leur exécution. Tant bien que mal, le maître Qui-Gon Jinn et son padawan Obi-Wan Kenobi réussissent à échapper aux griffes de la Fédération. Haako n’aimait pas les Jedi et sa nature craintive le poussa à se méfier du Seigneur Noir des Sith. D’ailleurs il ne manqua pas de faire partager son opinion à plusieurs reprises à Gunray, notamment quand il prit connaissance de l’existence de l’apprenti Sith Dark Maul, alors qu’il aidait Gunray à mener ses plans de conquête contre les Naboo et les Gungans. Malheureusement pour lui, la reine Amidala revint sur la planète et avec l’aide de ses gardes du corps Jedi et à la tête d’une puissante armée Gungan et Naboo, elle réussit à pénétrer dans l’enceinte du palais, et capturer Gunray ainsi que Rune Haako mettant alors fin à cette crise ayant commencé par la taxation des routes commerciales. Comme le vice-roi, Haako passa devant la cour suprême galactique et comme Gunray, il ne put être démis des ses fonctions. Il continua dès lors à suivre le vice-roi durant ses nouveaux projets. La Fédération signa le traité de la Confédération des Systèmes Indépendants et la Guerre des Clones éclata peu après, déchirant la galaxie en deux. 

Lors de l’assaut de Cato Neimoidia mené par Obi-Wan Kenobi et Anakin Skywalker, Nute Gunray et Rune Haako se hâtèrent de quitter leur quartier général en oubliant la précieuse mécanochaise qui servait de lien entre la Fédération du Commerce et Dark Sidious.
Devant agir à la hâte, le duo fut déplacé sur Utapau où ils apprirent la mort du Comte Dooku lors de la mission visant à capturer le Chancelier Palpatine et le tenir en otage.

Constamment, les leaders séparatistes dont Haako durent fuir pour ne pas être pris comme prisonniers par les Jedi. Puis, à la mort du Comte Dooku, Haako ainsi que les autres leaders furent placés en sécurité sur la planète volcanique de Mustafar. Là, le Seigneur des Sith Dark Sidious trahit la Confédération pour prendre le contrôle absolu de la République. Il envoya son nouvel apprenti, le seigneur Vador pour éliminer tous les leaders afin de terminer cette Guerre des Clones. D’un coup de sabre, Rune Haako fut assassiné par le sombre Seigneur des Sith.