Lorsque la rupture fut consommée entre les systèmes planétaires loyaux à la République Galactique et les systèmes accusant cette dernière de déchéance, les représentants de la nouvelle Confédération des Systèmes Indépendants se réunirent sur la planète Raxus pour y établir le Sénat Séparatiste. La vile de Raxulon devint ainsi la capitale de la CSI et le Sénat Séparatiste le lieu de débat et de décision des sénateurs. À la différence du Sénat Galactique, les parlementaires ne se réunissaient pas dans un hémicycle mais ils se faisaient face, assis sur des bancs parallèles, dans une pièce rectangulaire.

C’est au Sénat Séparatiste que la sénatrice Mina Bonteri parvint, à la surprise générale, à convaincre ses collègues de voter pour l’ouverture de négociations de paix avec la République Galactique. Son amie Padmé Amidala devait présenter cette même proposition au Sénat Galactique et les chances pour que la Guerre des Clones se termine rapidement devenaient réelles. Malheureusement, une attaque terroriste au Niveau 5000 de Coruscant perpétrée par le général Grievous enterra tout espoir de résolution du conflit et le comte Dooku reprit la main au Sénat Séparatiste pour que la Guerre des Clones continue encore quelques années.