Peu après, AP-5 fut sollicité par l'équipage du Ghost. En effet, les pirates Hondo Ohnaka et Azmorigan demandaient l'aide des rebelles pour voler la cargaison d'un cargo impérial, piégé dans les tempêtes atmosphériques de la planète Wynkahthu. Grâce à son expérience des vaisseaux impériaux, AP-5 fut en mesure d'analyser la situation et de définir le meilleur plan possible afin que la mission soit une réussite. Ainsi, le commando de résistants menés par Zeb s'introduisit dans le navire en perçant la coque. Suivant les conseils du droïde, ils devaient dans un premier temps redémarrer la centrale électrique du vaisseau de l'Empire.
Pendant la mission, AP-5 resta à bord du Ghost avec Hera Syndulla. De là, il supervisait le bon déroulement des évènements. Hélas, malgré ses capacités d'analyste caractéristiques des droïdes de protocole, AP-5 avait oublié un élément majeur: en réactivant le générateur de courant, les rebelles allumèrent en même temps un droïde sentinelle impérial. Ce robot fut rapidement détruit malgré les avertissements d'AP-5. En effet, la sentinelle mise hors service, d'autres droïdes impériaux s'activèrent pour traquer les intrus. Les rebelles durent alors lutter contre de nombreux robots ennemis, tout en évacuant la cargaison qu'ils étaient venu chercher, à savoir des explosifs. Finalement, l'équipage du Ghost s'en sortit in-extremis et AP-5 présenta ses excuses. Il était rare qu'il fasse des erreurs mais celle-ci avait bien faillit coûter la vie à ses amis!
Quelques temps après, AP-5 resta sur Atollon en compagnie de Zeb et Chopper tandis que l’équipage du Ghost partait pour un exercice d’entrainement. Le droïde profita alors de l’absence des rebelles pour entamer un inventaire des munitions.
A un moment, Zeb et Chopper ramenèrent un étrange droïde de protocole à la base nommé EXD-9. Ils l’avaient découvert abandonné dans le désert non loin de leur QG. AP-5 réactiva le nouveau droïde et décida de le prendre comme assistant afin de mener à bien la tâche difficile qu’était l’inventaire. Hélas, ce droïde de protocole en apparence inoffensif était en réalité un nouveau modèle de sondes impériales : les E-XD infiltrators. Et lorsque Zeb prononça le mot « rebelle », la programmation primaire du droïde de protocole prit le dessus ; sous les yeux d’AP-5, l’E-XD se transforma en véritable machine à tuer et passa en mode attaque. Il fallait un plan pour arrêter cette monstruosité mécanique avant que celle-ci ne détruise la base où prévienne l’Empire de leur localisation ! Ainsi, Chopper attira la sonde vers Zeb qui réussit à le neutraliser après une lutte acharnée. Enfin, AP-5 désactiva EXD-9.
Tout espoir n’était pas perdu pour les rebelles puisque AP-5 n’avait détecté aucune communication vers l’extérieur ; cela signifiait donc que le droïde ennemi n’avait pas eut le temps d’alerter les impériaux ! Mais déjà, EXD-9, alors désactivé, enclencha automatiquement son mode autodestruction. Si Chopper parvint à retarder l’explosion, il fallait à tous prix se débarrasser de la sonde ! Ainsi, ce fut AP-5 qui fut chargé de reprogrammer le chronomètre du robot impérial afin qu’il n’explose que lorsque que ce dernier serait à nouveau relié au réseau de l’Empire. Le trio rebelle renvoya le terrible EX-D infiltrator dans l’espace et le plan d’AP fonctionna à merveille. En effet, la sonde explosa à peine rentrée à bord du destroyer d’où elle avait été envoyée ! Ainsi, AP-5 pouvait être fier de lui : il venait de sauver la base des rebelles sur Atollon.
Par la suite, AP-5 accompagna Chopper et Ezra Bridger pour une mission délicate… Mais capitale pour la Rébellion ! Les rebelles avaient découvert que l’Empire surveillait les transmissions de Fulcrum, leur informateur. Or, ce dernier n’était autre que l’Agent impérial Fulcrum ! Aussi, le trio dépêché s’infiltra à bord du destroyer commandé par le lieutenant Yogar Lyste. En effet, c’était à son bord qu’était stationné Kallus.
Pour ce faire, AP-5 et ses 2 compagnons attirèrent l’attention des impériaux en volant une navette sur Lothal puis se laissèrent capturer par les impériaux. Le plan se déroulait à merveille : tandis qu’Ezra était conduit au bloc de détention, AP-5 et Chopper, camouflé en droïde impérial pour l’occasion prétendirent n’être que de simples robots qui s’étaient retrouvés dans la navette au moment du vol. Ainsi, ils furent libres et pouvaient désormais arpenter le destroyer sans encombre. Pourtant, la mission se compliqua lorsque le Grand-Amiral Thrawn demanda à interroger lui-même Ezra. Le jeune homme fut transféré à bord du Chimaera, le vaisseau de Thrawn. Tant bien que mal, AP-5 et Chopper parvinrent à trouver un prétexte afin de justifier d’être embarqué eux aussi.
Il n’y avait plus un instant à perdre. Rex et Kanan, censés récupérer les rebelles une fois leur mission accomplie n’allaient plus tarder à faire irruption. Les deux robots les prévinrent du changement de plan et récupérèrent les nouveaux codes pour se poser à bord du Chimaera. Mais une nouvelle information bouscula encore les plans des rebelles : Thrawn était sur le point de découvrir la localisation de la base des résistants. Aussi, tandis qu’AP-5 faisait le guet, Ezra, Kallus et Chopper pénétrèrent dans le bureau du Grand Amiral afin d’effacer les données. Cependant, Thrawn fut de retour plus rapidement que prévu à son bureau et les rebelles parvinrent à s’échapper de justesse. Entre temps, Kanan et Rex s’étaient posés afin de secourir leurs amis. Mais au moment d’embarquer, Kallus préféra rester dans les rangs de l’Empire afin de continuer à servir la Rébellion… Ces derniers temps, il avait en effet laissé pleins d’indices derrière lui, incriminant Yogar Lyste d’être le traître impérial. Ainsi, sa couverture était sauve et il pourrait continuer à informer les rebelles des agissements de l’Empire…Désormais, les rebelles planifiaient leur attaque contre l’usine d’armement située sur Lothal. Mais avant tout, il leur fallait obtenir les codes d’autorisations orbitales de Lothal afin d’espérer s’introduire sans être repéré… C’est pourquoi, AP-5, en compagnie de Chopper et Wedge Antilles voyagèrent jusqu’à la planète Killun 71 ; AP-5 et Chopper devaient s’infiltrer dans la Station Killun pour s’emparer de ces codes d’accès. A l’entrée de la station impériale, les droïdes durent passer un poste de contrôle d’identité. AP-5 le passa sans problèmes mais Chopper se fit détecter ce qui émit un message d’intrusion à un croiseur du système. Après une énième querelle avec Chopper, AP-5 continua seul sa mission. Il se dirigea vers le niveau où se trouvait l’ordinateur central sans encombre et téléchargea rapidement les données convoitées. Mais lorsque Chopper regagna la navette où les attendait Wedge, AP-5 remarqua vite le changement de comportement du robot : il semblait plus amical et parlait dans un langage impérial… En réalité, Chopper avait été piraté par une équipe impériale. En contrôlant le droïde astromécano, ils espéraient découvrir la localisation de la base rebelle.
AP-5 fit part de ses soupçons aux membres du Ghost. Si au départ les craintes du robot de protocole furent ignorées, Hera et ses amis durent vite se rendre à l’évidence : Chopper n’était plus maître de lui. Son plan désormais découvert, le Contrôleur impérial qui utilisait Chopper à distance fit en sorte d’enfermer l’équipe rebelle et de les lâcher dans le vide sidéral. Par l’intermédiaire de Chopper il était désormais en mesure de prendre le contrôle de tout le vaisseau et… de découvrir la localisation de leur QG ! Les résistants parvinrent à sécuriser la soute, leur évitant à tous une mort certaine dans l’espace. Il fut décidé d’envoyer AP-5, qui ne risquait rien dans le vide sidéral, à l’extérieur du véhicule. Grâce à ses pieds magnétiques, le robot fut en mesure de se déplacer à l’extérieur de la coque du Ghost et ouvrit la soute où étaient retenu captifs ses compagnons. Mais Chopper, toujours sous l’emprise impériale vint pour tenter d’empêcher AP-5 de mener à bien sa tâche… Mais il était trop tard ! Les rebelles avaient été libérés par l’action du robot de protocole et ils parvinrent à stopper Chopper. Hera parvint même à le libérer du contrôle des ingénieurs de l’Empire. AP-5, quand à lui, dérivait toujours depuis l’intervention inopinée de Chopper. Heureusement, ses compagnons rebelles vinrent à son secours après avoir réparé Chopper…