La Bad Batch s’est installée sur Ord Mantell et mène désormais une vie ordinaire entre deux missions pour Cid ! Les clones comprennent cependant rapidement que gagner leur indépendance financière sera plus difficile que prévu car leur nouvelle patronne comptabilise toutes leurs dépenses pour évaluer leur dette envers elle.
Après le vol d’un étrange lézard à des Rhokaï pour la Trandoshan, ils ont la grande surprise de voir le Capitaine Rex les attendre à la Cantina de Cid. En effet, suite à l’Ordre 66 la Bad Batch avait trouvé dans la base de données de l’Empire qu’il avait été enregistré comme mort au combat. Ainsi, l’ancien partenaire d’Anakin Skywalker et d’Ahsoka Tano, et l’un des seuls clones réguliers que la Bad Batch appréciaient, rencontre pour la première fois Omega.
Mais lorsque Rex apprend que Wrecker a des maux de tête de plus en plus fréquents il comprend que les clones n’ont pas retiré leurs puces inihibitrices et qu’à tout moment elles peuvent s’activer. Comme cela les rend extrêmement dangereux et imprévisibles, Rex ne peut leur faire confiance et dégaine son blaster pour s'éloigner d'eux. Il leur donne alors rendez-vous sur la planète Bracca où la Guilde des Ferrailleurs est chargée de démanteler les vaisseaux de la République ayant servis durant la Guerre des Clones pour qu’ils y trouvent tout l’équipement nécessaire à l'extraction de leurs puces.
En chemin Rex prend le temps d'en apprendre plus sur Omega et cette dernière l'informe qu'elle ne possède pas de Puce Inhibitrice mais qu’elle était au courant de son existence grâce à son travail auprès de la scientifique Nala Se. Une fois sur la planète décharge, les clones se retrouvent dans la salle médicale d’un Destroyer Stellaire Venator abandonné pour que Wrecker soit le premier à passer sur la table d’opération, son mal de tête provoqué par de très nombreux chocs durant les dernières missions étant devenu insupportable. Malheureusement, la puce prend le contrôle du clone juste avant qu’elle ne soit retirée et Wrecker attaque immédiatement ses camarades pour avoir violé l’Ordre 66.
Rex, Hunter et Echo tentent alors de l’éloigner de la salle d’opération mais Wrecker parvient à les neutraliser rapidement. Il se met ensuite à pourchasser Omega dans les couloirs du croiseur et, malgré les suppliques de la jeune fille pour qu’il ne l’exécute pas pour haute trahison, Wrecker n’hésite aucunement à lui tirer dessus car les bons soldats obéissent aux ordres. Heureusement, Rex parvient à l’assommer avant l’irréparable puis son corps inconscient est transporté de retour dans la salle médicale pour que Tech lui retire enfin sa puce.
Les trois autres clones passent également sur la table d'opération et, enfin libérés de toute attache à l’Empire, Rex peut désormais leur faire confiance. Il explique alors à Hunter que certaines personnes continuent toujours de se battre pour les idéaux de la République Galactique et que la Bad Batch est invitée à les rejoindre pour faire tomber l’Empire. Mais le clone décline cependant l’invitation car il estime que sa priorité est d’abord de protéger Omega et ses camarades, et rejoindre ce groupe de résistants serait trop dangereux pour la jeune fille.
Alors que Rex quitte la Bad Batch après le refus de Hunter de le suivre, des membres de la Guilde des Ferrailleurs repèrent le groupe de clones et avertissent les autorités impériales de cette présence irrégulière sur Bracca...